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MOLinsight
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Ferramenta Obchiral |
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O programa obchiral é uma ferramenta que fornece informações de quiralidade para todas as moléculas de um dado ficheiro. O formato de output inclui: Número da molécula Numeração e símbolo atómico do átomo quiral Lista ordenada da numeração dos quatro substituintes ligados ao átomo quiral [Atom4refs] Volume quiral [Volume] Lista ordenada de prioridade inicial arbitrária [Atom refs] 0 ou 1 [Clockwise?] $ $ $ O "$$$" é o separador entre várias entradas moleculares do ficheiro.
O valor de "clockwise" (0/1) corresponde à paridade estereoquímica disponível no bloco dos átomos do ficheiro SDF. Para especificar a paridade, os átomos que rodeiam o centro estéreo são numerados com 1, 2, 3 e 4, por ordem crescente de número de atómico (posição no bloco dos átomos) (o átomo de hidrogénio deverá ser considerado o átomo com maior numeração, neste caso atribui-se o número 4). O centro quiral é observado a partir de uma posição tal que átomo de maior numeração (4) fica para trás do plano definido pelos átomos 1, 2 e 3. Se o arranjo resultante destes três átomos por ordem crescente de numeração está no sentido dos ponteiros do relógio, a paridade é ‘1’. No caso contrário é ‘0’.
Comando obchiral: Obchiral nome.mol
Se quiser guardar os resultados obchiral num ficheiro resultados.txt, pode digitar o comando: obchiral nome.mol > resultado.txt
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Webmaster: última actualização: 27.03.2011
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